Все зависит от цели использования. Например, если вы выбираете в целях парсинг поисковых систем, то имейте ввиду, что яндекс-вордстат не поддерживает ipv6 протокол, а тот же гугл — запросто!
Перед тем, как приобрести ipv6 прокси, проверьте интересующий вас сайт в каком-нибудь сервисе по проверке поддержки ipv6 сайтом.
Если же вы сомневаетесь, какие прокси купить, берите ipv4 — они однозначно успешно взаимодействуют со всеми сайтами сети.